FUNPEP: Information system for "low complexity sequence regions".

Copyright (C) 1999, FUNPEP.

The lysozyme sequences from SWISSPROT. The multiple sequence alingment result is here.

>LYC_HUMAN
MKALIVLGLV LLSVTVQGKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA KWESGYNTRA 
TNYNAGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCS ALLQDNIADA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNRCQNRDVR QYVQGCGV

>LYC_GORGO
MKALIVLGLV LLSVMVQGKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA KWESGYNTRA 
TNYNAGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCS ALLQDNIADA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNRCQNRDVR QYVQGCGV

>LYC_PONPY
MKALIILGLV LLSVTVQSKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA KWESGYNTRA 
TNYNPGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCS ALLQDNIADA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNRCQNRDVR QYVQGCGV

>LYC_HYLLA
MKALIILGLV LLSVMVQAKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA KWESGYNTRA 
TNYNPGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCN ALLQDNIADA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNRCQNRDLR QYIQGCGV

>LYC_CERAE
MKAVIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWVCLA KWESGYNTQA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGKTPG AVNACHISCN ALLQDNIADA VTCAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNHCQNRDVS QYVQGCGV

>LYC_MACMU
MKAVIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWVCLA KWESNYNTQA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGKTPG AVNACHISCN ALLQDNIADA VTCAKRVVSD 
PQGIRAWVAW RNHCQNRDVS QYVQGCGV

>LYC_MIOTA
MKAVIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWVCLA KWESDYNTQA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGKTPG AVNACHISCN ALLQDNIADA VTCAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNHCHNRDVS QYVQGCGV

>LYC_PAPAN
MKAVIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWVCLA KWESDYNTQA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGKTPG AVNACHISCN ALLQDNIADA VTCAKRVVSD 
PQGIRAWVAW RNHCQNRDVS QYVQGCGV

>LYC_NASLA
MKALIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KKLGLDGYKG VSLANWVCLA KWESGYNTEA 
TNYNPGDEST DYGIFQINSR YWCNNGKTPG AVDACHISCS ALLQNNIADA VACAKRVVSD 
PQGIRAWVAW RNHCQNRDVS QYVKGCGV

>LYC_ALLNI
MKAVIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWVCLA KWESDYNTQA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGKTPG AVNACRISCN ALLQDNIADA VTCAKRVVRD 
PQGIRAWVAW RNHCQNRDVS QYVQGCGV

>LYC_PYGNE
MKALIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KKLGLDGYKG VSLANWVCLA KWESGYNTEA 
TNYNPGDEST DYGIFQINSR YWCNNGKTPG AVDACHISCS ALLQNNIADA VACAKRVVSD 
PQGVRAWVAW RNHCQNKDVS QYVKGCGV

>LYC_COLAN
MKALIILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KKLGLDGYKG VSLANWVCLA KWESGYNTDA 
TNYNPGDEST DYGIFQINSR YWCNNGKTPG AVNACHISCN ALLQNNIADA VACAKRVVSD 
PQGIRAWVAW KKHCQNRDVS QYVEGCGV

>LYC_PREEN
MKALTILGLV LLSVTVQGKI FERCELARTL KKLGLDGYKG VSLANWVCLA KWESGYNTEA 
TNYNPGDEST DYGIFQINSR YWCNNGKTPG AVDACHISCS ALLQNNIADA VACAKRVVSD 
PQGIRAWVAW RNHCQNKDVS QYVKGCGV

>LYC_SAISC
MKVLVILGLV LLSVMVQGKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA KWESDYNTRA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGRTPG AVNACHISCN ALLQDDITQA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW KAHCQNRDVS QYVQGCGV

>LYC_SAGOE
MKVLILLGLV LLSVMVQGKV FERCELARTL KRLGLDGYRG ISLANWMCLA KWESDYNTRA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGRTPG AVNACHISCN ALLQDDITEA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW KAHCQNRDVS QYIQGCGV

>LYC_CALJA
MKVLIILGLV LLSVMVQGKV FERCELARTL KRFGLDGYRG ISLANWMCLA KWESDYNTRA 
TNYNPGDQST DYGIFQINSH YWCNNGRTPG AVNACHISCN ALLQDDITEA VACAKRVVRD 
PQGIRAWVAW KAHCQNRDVS QYVQGCGV


Gergo Kiss 30th March 1999 EMBL/Szeged