FUNPEP: Information system for "low complexity sequence regions".

Copyright (C) 1999, FUNPEP.

The transthyretin sequences from SWISSPROT. The multiple sequence alingment result is here.

>TTHY_HUMAN
MASHRLLLLC LAGLVFVSEA GPTGTGESKC PLMVKVLDAV RGSPAINVAV HVFRKAADDT 
WEPFASGKTS ESGELHGLTT EEEFVEGIYK VEIDTKSYWK ALGISPFHEH AEVVFTANDS 
GPRRYTIAAL LSPYSYSTTA VVTNPKE

>TTHY_PIG
MASYRLLLLC LAGLVFVSEA GPAGAGESKC PLMVKVLDAV RGSPAVNVGV KVFKKAADGT 
WEPFALGKTS EFGELHGLTT DEKFVEGIYK VELDTKSYWK ALGISPFHEY AEVVFTANDS 
GRRHYTIAAL LSPYSYSTTA LVSSPKEGAL 

>TTHY_SHEEP
MASFRLLLLC LAGLVFVSEA SPAGAGESKC PLMVKVLDAV RGSPAANVGV KVFKKAADET 
WEPFASGKTS DSGELHGLTT EDKFVEGLYK VELDTKSYWK SLGISPFHEY AEVVFTANDS 
GLRHYTIAAL LSPYSYSTTA LVSSPKE

>TTHY_BOVIN
MASFRLFLLC LAGLVFVSEA GSVGAGEPKC PLMVKVLDAV RGSPAANVGV KVFKKAADET 
WEPFASGKTS ESGELHGLTT EDKFVEGLYK VELDTKSYWK SLGISPFHEF AEVVFTANDS 
GPRHYTIAAL LSPYSYSTTA LVSSPKA

>TTHY_RAT
MASLRLFLLC LAGLIFASEA GPGGAGESKC PLMVKVLDAV RGSPAVDVAV KVFKKTADGS 
WEPFASGKTA ESGELHGLTT DEKFTEGVYR VELDTKSYWK ALGISPFHEY AEVVFTANDS 
GHRHYTIAAL LSPYSYSTTA VVSNPQN

>TTHY_MOUSE
MASLRLFLLC LAGLVFVSEA GPAGAGESKC PLMVKVLDAV RGSPAVDVAV KVFKKTSEGS 
WEPFASGKTA ESGELHGLTT DEKFVEGVYR VELDTKSYWK TLGISPFHEF ADVVFTANDS 
GHRHYTIAAL LSPYSYSTTA VVSNPQN

>TTHY_RABIT
GPVGTGDSKC PLMVKVLDAV RGSPAVDVSV HVFKKAADET WEPFASGKTS KTGELHGLTT 
SEKFVEGVYK VELDTKSYWK ALGISPFHEY AEVVFTANDS GHRSYTIAAL LSPFSYSTTA 
VVSNPQE 

>TTHY_CHICK
MAFHSTLLVF LAGLVFLSEA APLVSHGSVD SKCPLMVKVL DAVRGSPAAN VAVKVFKKAA 
DGTWQDFATG KTTEFGEIHE LTTEEQFVEG VYRVEFDTSS YWKGLGLSPF HEYADVVFTA 
NDSGHRHYTI AALLSPFSYS TTAVVSDPQE 

>TTHY_PETBR
MAFHSLLLLC LAGLLFVSEA GPVAHGGEDS KCPLMVKVLD AVRGRPAVNV DVKVFKKTEK 
QTWELFASGK TNDNGEIHEL TSDDKFGEGL YKVEFDTISY WKALGVSPFH EYADVVFTAN 
DAGHRHYTIA AQLSPYSFST TAIVSNPTE

>TTHY_SMIMA
MAFHSLLLLC LAGLVFLSEA GPVAHGAEDS KCPLMVKVLD SVRGSPAVNV DVKVFKKTEE 
QTWELFASGK TNNNGEIHEL TSDDQFGEGL YKVEFDTVSY WKTFGISPFH EYADVVFTAN 
DAGHRHYTIA AQLSPFSFST TAVVSNPKD

>TTHY_CROPO
MAFHSMLLVF LAGLVFLTEA APLVSHGSID SKCPLMVKVL DAVRGSPAAN VAIKVFKKTS 
DGDWQEFAAG KTTEFGEVHE LTSDEKFVEG IYRVEFDTSS YWKALGLSPF HEYADVVFTA 
NDSGHRHYTI AALLSPFSYS TTAVVSDPQE 

>TTHY_MONDO
MAFHSLLLLG LASLLFVSDA APVIHGAEDS KCPLMVKVLD AVRGSPAVNV NVKVFKKSEE 
QTWEPFATGK TNDYGEIHEL TNDEKFGEGL YKVEFDTFSY WNALGVSPFH EYADVVFKAN 
DAGHRHYTIA ALLSPYSYST TAVVSNPKD

>TTHY_MACEU
MAFHSLLLLC LAGLAFVSET AAVHHEGEHS KCPLMVKVLD AVRGRPAVNV DVKVFKKTEE 
QTWELFAAGK TNDNGEIHEL TTDDKFGEGL YKVEFDTISY WKALGVSPFH EYADVVFTAN 
DAGHRHYTIA ALLSPYSFST TAIVSNPTE

>TTHY_MACGI
MAFHSLLLLC LAGLAFVSET AAVHHESEHS KCPLMVKVLD AVRGRPAVNV DVKVFKKTEE 
QTWELFAAGK TNDNGEIHEL TTDDKFGEGL YKVEFDTISY WKALGVSPFH EYADVVFTAN 
DAGHRHYTIA AQLSPYSFST TAIVSNPTE

>TTHY_TILRU
MGSSSLLLVC LAGMVYLTEA APLVSHGSID SKCPLMVKVL DAVRGRPATS IAVKVSKMSE 
EGDWKEFANG KTNEFGEIHE LTTDEQFVQG LYKVEFDTSS YWKALGVSPF HEYADVVFSA 
NDSGHRHYTI AALLSPFSYS TTAVVSDPKE 



Gergo Kiss 30th March 1999 EMBL/Szeged